Iezīmēšanas tolerance ir platība kvadrātmetros, kuru iezīmējot vēl uzskata par nenozīmīgu. Piemēram, ja tolerance ir 1000 m², tad, iezīmējot plānošanas apgabalu, tiks ņemti vērā tikai tie nogabalu fragmenti, kas ir lielāki par 1000 m².